Prospecção de Proteínas do Novo Coronavírus Covid-2019 e Potencial da Bioinformática na Busca de Novas Drogas Promissoras

Autores

DOI:

https://doi.org/10.9771/cp.v13i2.36008

Palavras-chave:

COVID-2019, Prospecção, Docagem molecular.

Resumo

O vírus COVID-2019, 2019-nCOV ou SARS-Cov-2 soma pouco mais de 290 mil casos e 12 mil mortes pelo mundo. Não existem estudos clínicos indicando tratamentos eficazes, e a identificação de agentes antivirais adequados constitui-se um passo crucial no combate à pandemia. O presente trabalho constitui o levantamento de proteínas do SARS-Cov-2 a partir do Protein Data Bank (PDB), elegíveis como alvos para docagem de substâncias inibitórias. Posteriormente, foram realizados testes in sílico, com dois alvos enzimáticos em interação com os fármacos Ledipasvir e Ombitasvir. A prospecção no PDB reportou 29 proteínas. Selecionou-se 6vsb e 6m17 para docagem com Ledispasvir, resultando energias de interação iguais a -6.88 e -6.25kJ/mol, respectivamente. Para os mesmos alvos, o fármaco Ombitasvir obteve -5,96 e -4,53kJ/mol. O estudo evidenciou o avanço nas pesquisas relacionadas ao COVID-19, apresentando 29 estruturas enzimáticas. Os fármacos Ledipasvir e Ombitasvir apresentaram parâmetros favoráveis para a continuação de estudos in vitro e clínicos.

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Biografia do Autor

Ruan Sousa Bastos, Universidade Federal do Pará

Graduado em Ciências Naturais/Química pela Universidade Federal do Maranhão - UFMA, Campus de Grajaú. Mestrando em Química Medicinal e Modelagem Molecular - UFPA. Participou do Programa Institucional de Bolsa de iniciação a Docência - PIBID e do Programa de Residência Pedagógica. Membro do Grupo de Pesquisa em Química Medicinal e Biotecnologia - QUIMEBIO e membro do Grupo de Pesquisa em Ciências Naturais e Biotecnologia - CIENATEC. Atua nas linhas de Biotecnologia e Química Quântica Computacional. 

Jefferson Santos Oliveira, Universidade Federal do Maranhão

pós graduando em Ciência dos materiais na universidade federal do Maranhão (PPGCM-UFMA). Licenciado em Química pelo Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia do Maranhão (IFMA). Atual linha de pesquisa constitui de síntese de cristais orgânicos e caracterização por Difração de Raios-X, Espectroscopia Raman, e Análise térmica. Foi bolsista de Iniciação científica na área de microbiologia, onde investigou a contaminação de Estafilococos no leite comercializado informalmente em Açailândia-MA. Ainda como aluno de Iniciação Científica, estudou as potencialidades de resíduos siderúrgicos (Escória de alto forno e pó do balão) como corretivos agrícolas. Também foi voluntário no Programa Institucional de Bolsas de Iniciação a Docência (PIBID), no qual desenvolveu atividades pedagógicas em um escola de ensino médio em Açailandia MA, e estudou a utilização de mapas conceituais para a revisão de curriculo de Química do Ensíno Médio.

Marcelo Henrique Vilhena da Silva, Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia do Pará

Possui graduação em Licenciatura Plena em Química pelo Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia do Pará (2004), graduação em odontologia pela Universidade Federal do Pará (2011) e mestrado em Engenharia Mecânica pela Universidade Federal do Pará (2018). Atualmente é professor ebtt do Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia do Pará. Tem experiência na área de Química, com ênfase em Corrosão, Ensino, Química Ambiental.

Francisco das Chagas Alves Lima, Universidade Estadual do Piau

Graduado em Licenciatura Plena em Química pela Universidade Federal do Piauí (2002), mestrado pela Universidade de São Paulo (2004). Doutor pela Universidade de São Paulo no Instituto de Química de São Carlos (2008).

Jefferson Almeida Rocha, Universidade Federal do Maranhão

Graduado em Ciências Biológicas pela Universidade Estadual do Piauí - UESPI onde participou do grupo de pesquisas em microbiologia - LABMICRO. Possui Especialização em Gestão Ambiental pela Faculdade Latino-americana de Educação - FLATED, com ênfase em Recursos Hídricos. Mestre em Biotecnologia pela Universidade Federal do Piauí - UFPI. Doutor em Biotecnologia pela Rede Nordeste de Biotecnologia - RENORBIO. Líder/Fundador do Grupo de Pesquisa em Ciências Naturais e Biotecnologia - CIENATEC da UFMA/Campus de Grajaú. Atualmente é Professor Adjunto na Universidade Federal do Maranhão - UFMA, Campus de São Bernardo, Membro permanente do Mestrado Profissional em Propriedade Intelectual e Transferência de Tecnologia em Rede (PROFNIT/UFMA) e Membro permanente do Programa de Pos-Graduação em Biotecnologia - PPGBiotec, em nível de mestrado da Universidade Federal do Delta do Parnaíba - UFDPAR. Atua nas linhas de Biotecnologia, Química Medicinal, Química Quântica Computacional, Bioinformática, Bioprospecção de extratos bioativos, Pesquisas contra Doenças Negligenciadas e Propriedade Intelectual e Inovação.

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Publicado

2020-04-16

Como Citar

Bastos, R. S., Sousa, C. S. ., Oliveira, J. S. ., Silva, M. H. V. da ., Lima, F. das C. A., & Rocha, J. A. . (2020). Prospecção de Proteínas do Novo Coronavírus Covid-2019 e Potencial da Bioinformática na Busca de Novas Drogas Promissoras. Cadernos De Prospecção, 13(2), 347. https://doi.org/10.9771/cp.v13i2.36008

Edição

v. 13 n. 2 (2020): Edição Especial - Coronavírus (SARS-COV-2) e COVID-19

Seção

Coronavirus (SARS-COV-2) e COVID-19

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